Um die inhaltlichen Schwerpunkte und Expertisen der KPH in einzelnen Leistungsbereichen professionell weiterentwickeln zu können, sind in der Organisationsstruktur Kompetenzzentren vorgesehen, die direkt dem Rektorat unterstellt sind.
Ein Kompetenzzentrum versammelt die ExpertInnen der KPH an einzelnen thematischen Schnittstellen mit dem Auftrag gezielte, nach Möglichkeit interdisziplinäre Leistungsangebote zu entwickeln.